随后，台湾各个港口都被暂时关闭，港外由台湾的鱼雷艇部队开始布设水雷，任何进出船只都将由台湾海军带领，才能够安全出入。而台湾潜艇部队的基地，都实施了战时封锁，任何人未经国防部批准，都不能进出。

3月11日，6国联军在香港宣布成立，由英法德3国凑集的20多艘运兵船，开始从日本本土和海参崴把日本陆军和俄国陆军运往香港岛，头一批抵达香港的日本陆军就有1个整编常备师团，共计3万3千多人，其后，还将有1个日本师团和5000俄国陆军抵达。

3月15日，6国以联军的形式，向台湾政府发出最后的通牒，命令台湾政府解散非法政府和非法武装，向6**队投降，而台湾将被6国接管，由6国统一管理，通牒的最后期限为3月20日。

在6国联军行程的过程中，还出了一个花絮，那就是美国政府的加入6国联军提议，在国会参众两院中未被通过，以美国西海岸和南部各州参议员和众议员为首的多数派，对于毫无利益的武力干涉一个岛国的军事行动，予以了否决。按照当时德州议员的话来说：与其动用宝贵的武力去干涉一个台湾，还不如投入到镇压菲律宾的独立起义中来的划算。就这样，美国海军和陆军无法正式参加6国联军，只得作为一个观察员，出动了一艘后勤舰和几十名海军军官，跟在6国后边权当几日游了。

最后通牒发出以后，台湾政府不仅没有回复，还宣布台湾周围海域30海里以内，为台湾领海，任何武装船只进入台湾领海，都将受到台湾海军的攻击。

这纯粹就是和6国对着干啊，6国联军见状也不等最后通牒到期了，在3月18日，就全军出动，以3艘战列舰3艘重型巡洋舰为主力，6艘巡洋舰和20多艘驱逐舰为先锋，浩浩荡荡的杀奔了台湾。

不得不说的是英国海军不愧为世界第一的海军，虽然他们也没有和潜艇正面交手过，但是仅凭着从日、俄两国海军幸存人员的描述中，就做出了一个非常正确的选择，那就是让驱逐舰和轻型巡洋舰游弋在主力舰队的四周，这样不仅能扩大舰队的观察范围，而且可以在必要的时候为主力舰船抵挡鱼雷的攻击。

而且，作为这次进攻台湾的杀手锏，并不是这只看似强大的海军舰队，而是另一支偷偷摸摸在深夜出发的运兵船队。这个方案是由日本陆军和海军提出来的，由于日本海军深知台湾潜艇的厉害，他们不太相信这只拼凑的貌似强大的6国舰队能一举突破台湾潜艇的防线，而深深的仇恨让日本人甘愿冒险，他们在6**事会议上提出，让6国舰队带领着俄国的陆军为第一路进攻部队，而日本只需要借用20艘运兵船，且不动用以运抵香港的那一个师团的兵力，而是从日本本土再运一个兵团，分批抵达美国占领的菲律宾，然后再从菲律宾趁着夜色出发，在凌晨抵达台湾的南部海港杜寮，从杜寮港登陆，向台湾内陆发起进攻。

6国对于日本人的计划给予了充分的肯定，不仅提供了运兵船，还附送2艘驱逐舰担当护卫和炮火支援。在6国舰队出发的前一周，日本人就利用6国提供的商船，分批分波的把日本本土的常备第六师团运送到了美国占领的菲律宾，而且没有集中在马尼拉港，而是在菲律宾北部海岸的克拉维利亚附近建造了一个临时驻地。在这点上说，日本陆军很具有吃苦耐劳的精神，他们为了隐藏自己的行踪，到达隐蔽地以后，整整3万人，只带着随身的干粮，不用补给船运送补给，生生在一片被原始森林包围的海滩上熬了1个多礼拜，直到上船出发，才得到头一次补给。

日本人的苦没有白受，台湾间谍和潜艇，都只注意了各国的主要海军基地和作战船只，没有发现这些搭载着外国商船分批抵达的日本陆军，这也为日后的台湾陆上争夺打开了大门。